มีเทนบางชนิดอาจเกิดจากกระบวนการอนินทรีย์ แหล่งกำเนิดคาร์บอนดั้งเดิมของโลกคือเศษซากจักรวาลที่ดาวเคราะห์ก่อตัวขึ้น หากอุกกาบาตเป็นตัวแทนของเศษซากนี้ คาร์บอนอาจถูกจ่ายไปในความเข้มข้นที่ค่อนข้างสูงเหมือนกับไฮโดรคาร์บอน เช่น ที่พบในอุกกาบาตประเภทคาร์บอเนตคอนไดรต์ การปล่อยก๊าซไฮโดรคาร์บอนเหล่านี้อย่างต่อเนื่องอาจเกิดขึ้นจากภายในโลก และบางส่วนอาจสะสมเป็นก๊าซเอบีโอเจนิกโดยไม่ผ่านสถานะอินทรีย์ อย่างไรก็ตาม ในกรณีที่มีการปล่อยก๊าซออกอย่างกว้างขวาง มีแนวโน้มว่าก๊าซอะบิเจนิกจะแพร่กระจายเกินกว่าจะเป็นประโยชน์เชิงพาณิชย์ ยังไม่พบการสะสมมีเทนอนินทรีย์ที่มีนัยสำคัญ
ฮีเลียมและอาร์กอนบางส่วนที่พบในก๊าซธรรมชาติเป็นผลิตภัณฑ์จากการแตกตัวของกัมมันตภาพรังสีตามธรรมชาติ ฮีเลียมมาจากไอโซโทปรังสีของทอเรียมและตระกูลยูเรเนียม ส่วนอาร์กอนมาจากโพแทสเซียม อาจเป็นเรื่องบังเอิญที่บางครั้งฮีเลียมและอาร์กอนเกิดขึ้นกับก๊าซธรรมชาติ ก๊าซที่ไม่เกี่ยวข้องก็ติดอยู่ในกับดักเดียวกัน
